Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAV1P15498 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAV1P15498 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAV1P15498 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAV1P15498 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
VAV1P15498 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAV1P15498 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAV1P15498 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAV1P15498 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAV1P15498 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAV1P15498 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAV1P15498 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAV1P15498 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAV1P15498 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAV1P15498 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAV1P15498 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAV1P15498 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAV1P15498 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VAV1P15498 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAV1P15498 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAV1P15498 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAV1P15498 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAV1P15498 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAV1P15498 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VAV1P15498 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAV1P15498 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VAV1P15498 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAV1P15498 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAV1P15498 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAV1P15498 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAV1P15498 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAV1P15498 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAV1P15498 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAV1P15498 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAV1P15498 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAV1P15498 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAV1P15498 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAV1P15498 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAV1P15498 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAV1P15498 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAV1P15498 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAV1P15498 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAV1P15498 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAV1P15498 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAV1P15498 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAV1P15498 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VAV1P15498 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAV1P15498 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAV1P15498 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAV1P15498 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAV1P15498 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAV1P15498 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAV1P15498 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAV1P15498 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAV1P15498 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAV1P15498 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAV1P15498 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VAV1P15498 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAV1P15498 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAV1P15498 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAV1P15498 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAV1P15498 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAV1P15498 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAV1P15498 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAV1P15498 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAV1P15498 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAV1P15498 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAV1P15498 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAV1P15498 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAV1P15498 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAV1P15498 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAV1P15498 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAV1P15498 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAV1P15498 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAV1P15498 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAV1P15498 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAV1P15498 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAV1P15498 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VAV1P15498 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAV1P15498 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAV1P15498 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VAV1P15498 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAV1P15498 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAV1P15498 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAV1P15498 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAV1P15498 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VAV1P15498 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAV1P15498 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VAV1P15498 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAV1P15498 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAV1P15498 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAV1P15498 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAV1P15498 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VAV1P15498 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAV1P15498 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAV1P15498 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAV1P15498 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAV1P15498 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAV1P15498 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VAV1P15498 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms