Protein–RNA interactions for Protein: P04433

IGKV3-11, Immunoglobulin kappa variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-11P04433 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGKV3-11P04433 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms