Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX7O95931 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX7O95931 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX7O95931 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX7O95931 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX7O95931 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX7O95931 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBX7O95931 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CBX7O95931 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms