Protein–RNA interactions for Protein: O95628

CNOT4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4O95628 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNOT4O95628 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNOT4O95628 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNOT4O95628 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNOT4O95628 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNOT4O95628 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNOT4O95628 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNOT4O95628 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNOT4O95628 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CNOT4O95628 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNOT4O95628 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNOT4O95628 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNOT4O95628 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNOT4O95628 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNOT4O95628 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNOT4O95628 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNOT4O95628 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNOT4O95628 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CNOT4O95628 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNOT4O95628 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNOT4O95628 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNOT4O95628 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNOT4O95628 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNOT4O95628 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNOT4O95628 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT4O95628 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT4O95628 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT4O95628 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT4O95628 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT4O95628 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT4O95628 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT4O95628 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT4O95628 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT4O95628 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT4O95628 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT4O95628 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT4O95628 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT4O95628 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT4O95628 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT4O95628 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNOT4O95628 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT4O95628 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT4O95628 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT4O95628 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT4O95628 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNOT4O95628 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT4O95628 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT4O95628 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNOT4O95628 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT4O95628 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT4O95628 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT4O95628 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT4O95628 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT4O95628 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms