Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALX3O95076 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALX3O95076 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ALX3O95076 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ALX3O95076 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ALX3O95076 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ALX3O95076 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ALX3O95076 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ALX3O95076 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ALX3O95076 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ALX3O95076 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ALX3O95076 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ALX3O95076 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ALX3O95076 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ALX3O95076 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALX3O95076 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ALX3O95076 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms