Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL18O94889 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms