Protein–RNA interactions for Protein: O75437

ZNF254, Zinc finger protein 254, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF254O75437 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF254O75437 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF254O75437 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF254O75437 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF254O75437 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF254O75437 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF254O75437 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF254O75437 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF254O75437 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF254O75437 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF254O75437 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF254O75437 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF254O75437 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF254O75437 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF254O75437 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF254O75437 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF254O75437 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF254O75437 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF254O75437 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF254O75437 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms