Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PPFIA4O75335 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPFIA4O75335 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms