Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNSO60931 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNSO60931 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNSO60931 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNSO60931 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNSO60931 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTNSO60931 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTNSO60931 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTNSO60931 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNSO60931 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNSO60931 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNSO60931 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNSO60931 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNSO60931 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNSO60931 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNSO60931 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNSO60931 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNSO60931 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNSO60931 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNSO60931 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNSO60931 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms