Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCO2O43819 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCO2O43819 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCO2O43819 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCO2O43819 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCO2O43819 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCO2O43819 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCO2O43819 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCO2O43819 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCO2O43819 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCO2O43819 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCO2O43819 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCO2O43819 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms