Protein–RNA interactions for Protein: O15066

KIF3B, Kinesin-like protein KIF3B, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3BO15066 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF3BO15066 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms