Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms