Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms