Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MCRIP1C9JLW8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms