Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms