Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms