Protein–RNA interactions for Protein: R4GN57

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GN57 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
R4GN57 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
R4GN57 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
R4GN57 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
R4GN57 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
R4GN57 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
R4GN57 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
R4GN57 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
R4GN57 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
R4GN57 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
R4GN57 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
R4GN57 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
R4GN57 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
R4GN57 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
R4GN57 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
R4GN57 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
R4GN57 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
R4GN57 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
R4GN57 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
R4GN57 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
R4GN57 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
R4GN57 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
R4GN57 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
R4GN57 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
R4GN57 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
R4GN57 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
R4GN57 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
R4GN57 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
R4GN57 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
R4GN57 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
R4GN57 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
R4GN57 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
R4GN57 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
R4GN57 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
R4GN57 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
R4GN57 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R4GN57 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
R4GN57 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R4GN57 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
R4GN57 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
R4GN57 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
R4GN57 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
R4GN57 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
R4GN57 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
R4GN57 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
R4GN57 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
R4GN57 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R4GN57 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R4GN57 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
R4GN57 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
R4GN57 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
R4GN57 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
R4GN57 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
R4GN57 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
R4GN57 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
R4GN57 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
R4GN57 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
R4GN57 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
R4GN57 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
R4GN57 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
R4GN57 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
R4GN57 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
R4GN57 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R4GN57 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
R4GN57 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R4GN57 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
R4GN57 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R4GN57 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R4GN57 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
R4GN57 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
R4GN57 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
R4GN57 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
R4GN57 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
R4GN57 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
R4GN57 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
R4GN57 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
R4GN57 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
R4GN57 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
R4GN57 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
R4GN57 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
R4GN57 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
R4GN57 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
R4GN57 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
R4GN57 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
R4GN57 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
R4GN57 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
R4GN57 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
R4GN57 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
R4GN57 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
R4GN57 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
R4GN57 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
R4GN57 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
R4GN57 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
R4GN57 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
R4GN57 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
R4GN57 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
R4GN57 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
R4GN57 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
R4GN57 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
R4GN57 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.8 ms