Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAD1L1Q9Y6D9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MAD1L1Q9Y6D9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MAD1L1Q9Y6D9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAD1L1Q9Y6D9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAD1L1Q9Y6D9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAD1L1Q9Y6D9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAD1L1Q9Y6D9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAD1L1Q9Y6D9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAD1L1Q9Y6D9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAD1L1Q9Y6D9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAD1L1Q9Y6D9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAD1L1Q9Y6D9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAD1L1Q9Y6D9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAD1L1Q9Y6D9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MAD1L1Q9Y6D9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAD1L1Q9Y6D9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAD1L1Q9Y6D9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAD1L1Q9Y6D9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAD1L1Q9Y6D9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAD1L1Q9Y6D9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAD1L1Q9Y6D9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MAD1L1Q9Y6D9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAD1L1Q9Y6D9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAD1L1Q9Y6D9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAD1L1Q9Y6D9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAD1L1Q9Y6D9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAD1L1Q9Y6D9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAD1L1Q9Y6D9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAD1L1Q9Y6D9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAD1L1Q9Y6D9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms