Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD54BQ9Y620 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD54BQ9Y620 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD54BQ9Y620 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD54BQ9Y620 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD54BQ9Y620 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD54BQ9Y620 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD54BQ9Y620 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD54BQ9Y620 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD54BQ9Y620 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD54BQ9Y620 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD54BQ9Y620 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD54BQ9Y620 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RAD54BQ9Y620 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD54BQ9Y620 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAD54BQ9Y620 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD54BQ9Y620 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD54BQ9Y620 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD54BQ9Y620 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD54BQ9Y620 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD54BQ9Y620 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD54BQ9Y620 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD54BQ9Y620 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD54BQ9Y620 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD54BQ9Y620 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD54BQ9Y620 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD54BQ9Y620 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD54BQ9Y620 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD54BQ9Y620 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD54BQ9Y620 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD54BQ9Y620 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms