Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX9Q9Y5X1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SNX9Q9Y5X1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX9Q9Y5X1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms