Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
USP16Q9Y5T5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
USP16Q9Y5T5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
USP16Q9Y5T5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
USP16Q9Y5T5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
USP16Q9Y5T5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
USP16Q9Y5T5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
USP16Q9Y5T5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
USP16Q9Y5T5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
USP16Q9Y5T5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
USP16Q9Y5T5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
USP16Q9Y5T5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
USP16Q9Y5T5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
USP16Q9Y5T5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
USP16Q9Y5T5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
USP16Q9Y5T5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
USP16Q9Y5T5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
USP16Q9Y5T5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
USP16Q9Y5T5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
USP16Q9Y5T5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
USP16Q9Y5T5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
USP16Q9Y5T5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
USP16Q9Y5T5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
USP16Q9Y5T5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
USP16Q9Y5T5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
USP16Q9Y5T5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
USP16Q9Y5T5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
USP16Q9Y5T5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
USP16Q9Y5T5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
USP16Q9Y5T5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
USP16Q9Y5T5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
USP16Q9Y5T5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
USP16Q9Y5T5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
USP16Q9Y5T5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
USP16Q9Y5T5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
USP16Q9Y5T5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
USP16Q9Y5T5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
USP16Q9Y5T5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
USP16Q9Y5T5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
USP16Q9Y5T5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
USP16Q9Y5T5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
USP16Q9Y5T5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
USP16Q9Y5T5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
USP16Q9Y5T5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
USP16Q9Y5T5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
USP16Q9Y5T5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
USP16Q9Y5T5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
USP16Q9Y5T5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
USP16Q9Y5T5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
USP16Q9Y5T5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
USP16Q9Y5T5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
USP16Q9Y5T5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
USP16Q9Y5T5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
USP16Q9Y5T5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
USP16Q9Y5T5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
USP16Q9Y5T5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
USP16Q9Y5T5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
USP16Q9Y5T5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
USP16Q9Y5T5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
USP16Q9Y5T5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
USP16Q9Y5T5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
USP16Q9Y5T5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
USP16Q9Y5T5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
USP16Q9Y5T5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
USP16Q9Y5T5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
USP16Q9Y5T5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
USP16Q9Y5T5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
USP16Q9Y5T5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP16Q9Y5T5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP16Q9Y5T5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP16Q9Y5T5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP16Q9Y5T5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP16Q9Y5T5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP16Q9Y5T5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP16Q9Y5T5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
USP16Q9Y5T5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
USP16Q9Y5T5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP16Q9Y5T5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP16Q9Y5T5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP16Q9Y5T5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP16Q9Y5T5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP16Q9Y5T5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP16Q9Y5T5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
USP16Q9Y5T5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
USP16Q9Y5T5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
USP16Q9Y5T5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
USP16Q9Y5T5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
USP16Q9Y5T5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
USP16Q9Y5T5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
USP16Q9Y5T5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP16Q9Y5T5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP16Q9Y5T5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP16Q9Y5T5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
USP16Q9Y5T5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP16Q9Y5T5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
USP16Q9Y5T5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
USP16Q9Y5T5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
USP16Q9Y5T5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
USP16Q9Y5T5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
USP16Q9Y5T5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms