Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P2

CSAG2, Chondrosarcoma-associated gene 2/3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG2Q9Y5P2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSAG2Q9Y5P2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSAG2Q9Y5P2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSAG2Q9Y5P2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSAG2Q9Y5P2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSAG2Q9Y5P2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSAG2Q9Y5P2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSAG2Q9Y5P2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSAG2Q9Y5P2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSAG2Q9Y5P2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSAG2Q9Y5P2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSAG2Q9Y5P2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSAG2Q9Y5P2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms