Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN16Q9Y5I7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN16Q9Y5I7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN16Q9Y5I7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN16Q9Y5I7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN16Q9Y5I7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN16Q9Y5I7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN16Q9Y5I7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN16Q9Y5I7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN16Q9Y5I7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN16Q9Y5I7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN16Q9Y5I7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN16Q9Y5I7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN16Q9Y5I7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN16Q9Y5I7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN16Q9Y5I7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN16Q9Y5I7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN16Q9Y5I7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN16Q9Y5I7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN16Q9Y5I7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN16Q9Y5I7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms