Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y572

RIPK3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK3Q9Y572 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIPK3Q9Y572 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIPK3Q9Y572 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RIPK3Q9Y572 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIPK3Q9Y572 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIPK3Q9Y572 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK3Q9Y572 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK3Q9Y572 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK3Q9Y572 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK3Q9Y572 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK3Q9Y572 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK3Q9Y572 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK3Q9Y572 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK3Q9Y572 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIPK3Q9Y572 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIPK3Q9Y572 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIPK3Q9Y572 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIPK3Q9Y572 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIPK3Q9Y572 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIPK3Q9Y572 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIPK3Q9Y572 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIPK3Q9Y572 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIPK3Q9Y572 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIPK3Q9Y572 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RIPK3Q9Y572 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RIPK3Q9Y572 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIPK3Q9Y572 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIPK3Q9Y572 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIPK3Q9Y572 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIPK3Q9Y572 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIPK3Q9Y572 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIPK3Q9Y572 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RIPK3Q9Y572 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIPK3Q9Y572 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIPK3Q9Y572 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIPK3Q9Y572 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RIPK3Q9Y572 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIPK3Q9Y572 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIPK3Q9Y572 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIPK3Q9Y572 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIPK3Q9Y572 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RIPK3Q9Y572 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RIPK3Q9Y572 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIPK3Q9Y572 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIPK3Q9Y572 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIPK3Q9Y572 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIPK3Q9Y572 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIPK3Q9Y572 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIPK3Q9Y572 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIPK3Q9Y572 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIPK3Q9Y572 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIPK3Q9Y572 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIPK3Q9Y572 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIPK3Q9Y572 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIPK3Q9Y572 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIPK3Q9Y572 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIPK3Q9Y572 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RIPK3Q9Y572 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIPK3Q9Y572 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIPK3Q9Y572 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIPK3Q9Y572 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIPK3Q9Y572 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIPK3Q9Y572 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIPK3Q9Y572 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIPK3Q9Y572 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIPK3Q9Y572 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIPK3Q9Y572 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIPK3Q9Y572 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIPK3Q9Y572 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RIPK3Q9Y572 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RIPK3Q9Y572 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIPK3Q9Y572 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RIPK3Q9Y572 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms