Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMED7Q9Y3B3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMED7Q9Y3B3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED7Q9Y3B3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms