Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HHLA3Q9XRX5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HHLA3Q9XRX5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms