Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX6Q9UNH7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX6Q9UNH7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX6Q9UNH7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX6Q9UNH7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX6Q9UNH7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX6Q9UNH7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX6Q9UNH7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX6Q9UNH7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX6Q9UNH7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX6Q9UNH7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX6Q9UNH7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX6Q9UNH7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX6Q9UNH7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX6Q9UNH7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX6Q9UNH7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX6Q9UNH7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX6Q9UNH7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX6Q9UNH7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX6Q9UNH7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms