Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PACSIN3Q9UKS6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PACSIN3Q9UKS6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3Q9UKS6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms