Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TUBE1Q9UJT0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TUBE1Q9UJT0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBE1Q9UJT0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms