Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEFF2Q9UIK5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEFF2Q9UIK5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEFF2Q9UIK5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms