Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID6

ZNF639, Zinc finger protein 639, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF639Q9UID6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF639Q9UID6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF639Q9UID6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF639Q9UID6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF639Q9UID6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF639Q9UID6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF639Q9UID6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF639Q9UID6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF639Q9UID6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF639Q9UID6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF639Q9UID6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF639Q9UID6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF639Q9UID6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF639Q9UID6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF639Q9UID6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF639Q9UID6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF639Q9UID6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF639Q9UID6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms