Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FBXO40Q9UH90 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
FBXO40Q9UH90 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FBXO40Q9UH90 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FBXO40Q9UH90 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FBXO40Q9UH90 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FBXO40Q9UH90 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FBXO40Q9UH90 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FBXO40Q9UH90 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FBXO40Q9UH90 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FBXO40Q9UH90 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FBXO40Q9UH90 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FBXO40Q9UH90 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FBXO40Q9UH90 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FBXO40Q9UH90 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FBXO40Q9UH90 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FBXO40Q9UH90 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FBXO40Q9UH90 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FBXO40Q9UH90 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FBXO40Q9UH90 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FBXO40Q9UH90 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FBXO40Q9UH90 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FBXO40Q9UH90 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FBXO40Q9UH90 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
FBXO40Q9UH90 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FBXO40Q9UH90 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms