Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NKX1-2Q9UD57 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NKX1-2Q9UD57 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX1-2Q9UD57 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-2Q9UD57 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms