Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPS7AQ9UBW8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COPS7AQ9UBW8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPS7AQ9UBW8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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