Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ5

EIF3K, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3KQ9UBQ5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3KQ9UBQ5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
EIF3KQ9UBQ5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms