Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL9Q9P2J3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL9Q9P2J3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms