Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP36Q9P275 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP36Q9P275 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms