Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFA13Q9P0J0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFA13Q9P0J0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms