Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN3Q9NZ94 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms