Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTM6Q9NX76 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTM6Q9NX76 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTM6Q9NX76 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CMTM6Q9NX76 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CMTM6Q9NX76 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMTM6Q9NX76 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMTM6Q9NX76 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms