Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RHBDL2Q9NX52 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHBDL2Q9NX52 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHBDL2Q9NX52 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms