Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJC28Q9NX36 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DNAJC28Q9NX36 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJC28Q9NX36 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms