Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf109Q9NX04 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf109Q9NX04 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf109Q9NX04 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf109Q9NX04 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf109Q9NX04 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf109Q9NX04 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf109Q9NX04 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf109Q9NX04 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf109Q9NX04 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf109Q9NX04 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf109Q9NX04 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf109Q9NX04 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf109Q9NX04 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf109Q9NX04 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf109Q9NX04 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf109Q9NX04 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf109Q9NX04 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf109Q9NX04 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf109Q9NX04 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf109Q9NX04 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf109Q9NX04 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf109Q9NX04 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf109Q9NX04 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf109Q9NX04 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf109Q9NX04 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms