Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SPTLC3Q9NUV7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPTLC3Q9NUV7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPTLC3Q9NUV7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPTLC3Q9NUV7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms