Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GINM1Q9NU53 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GINM1Q9NU53 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GINM1Q9NU53 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GINM1Q9NU53 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GINM1Q9NU53 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GINM1Q9NU53 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GINM1Q9NU53 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GINM1Q9NU53 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GINM1Q9NU53 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GINM1Q9NU53 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GINM1Q9NU53 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GINM1Q9NU53 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GINM1Q9NU53 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GINM1Q9NU53 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GINM1Q9NU53 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GINM1Q9NU53 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GINM1Q9NU53 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GINM1Q9NU53 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GINM1Q9NU53 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GINM1Q9NU53 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GINM1Q9NU53 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GINM1Q9NU53 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GINM1Q9NU53 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GINM1Q9NU53 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GINM1Q9NU53 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GINM1Q9NU53 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GINM1Q9NU53 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GINM1Q9NU53 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GINM1Q9NU53 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GINM1Q9NU53 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GINM1Q9NU53 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GINM1Q9NU53 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms