Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.891e-6■■■■■ 42.8
DROSHAQ9NRR4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.275e-8■■■■■ 42.5
DROSHAQ9NRR4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.055e-8■■■■■ 42.5
DROSHAQ9NRR4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.965e-8■■■■■ 42.5
DROSHAQ9NRR4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.935e-8■■■■■ 42.5
DROSHAQ9NRR4 NKTR-204ENST00000445842 560 ntTSL 535.56■■■■□ 3.288e-28■■■■■ 42.5
DROSHAQ9NRR4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.848e-28■■■■■ 42.5
DROSHAQ9NRR4 NKTR-214ENST00000478488 698 ntTSL 326.47■■□□□ 1.838e-28■■■■■ 42.5
DROSHAQ9NRR4 NKTR-215ENST00000487466 2335 ntTSL 223.93■■□□□ 1.428e-28■■■■■ 42.5
DROSHAQ9NRR4 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.398e-28■■■■■ 42.5
DROSHAQ9NRR4 NKTR-211ENST00000468735 7964 ntTSL 210.02□□□□□ -0.818e-28■■■■■ 42.5
DROSHAQ9NRR4 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.588e-28■■■■■ 42.5
DROSHAQ9NRR4 NKTR-202ENST00000429888 7325 ntTSL 54.91□□□□□ -1.628e-28■■■■■ 42.5
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC9-210ENST00000521667 2021 ntTSL 1 (best)27.56■■■□□ 22e-6■■■■■ 42.3
DROSHAQ9NRR4 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.982e-6■■■■■ 42.3
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC9-203ENST00000517667 518 ntTSL 318.51■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 42.3
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC9-208ENST00000520857 3693 ntTSL 1 (best)17.17■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 42.3
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 42.3
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC9-202ENST00000438773 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 42.3
DROSHAQ9NRR4 TRAPPC9-207ENST00000520532 560 ntTSL 511.54□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 42.3
DROSHAQ9NRR4 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.182e-6■■■■■ 42
DROSHAQ9NRR4 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC22.77■■□□□ 1.243e-17■■■■■ 41.9
DROSHAQ9NRR4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.941e-7■■■■■ 41.8
DROSHAQ9NRR4 AL034397.3-202ENST00000621933 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.544e-12■■■■■ 41.6
DROSHAQ9NRR4 AL034397.3-201ENST00000618234 1690 ntTSL 1 (best)10.97□□□□□ -0.654e-12■■■■■ 41.6
DROSHAQ9NRR4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.95e-9■■■■■ 41.5
DROSHAQ9NRR4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.035e-9■■■■■ 41.5
DROSHAQ9NRR4 HNRNPK-205ENST00000376281 2928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.435e-9■■■■■ 41.5
DROSHAQ9NRR4 RXRA-201ENST00000356384 5770 ntTSL 518.32■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 41.5
DROSHAQ9NRR4 BCKDHA-204ENST00000538423 816 ntTSL 529.52■■■□□ 2.323e-6■■■■■ 41.5
DROSHAQ9NRR4 BCKDHA-206ENST00000542943 994 ntTSL 528.24■■■□□ 2.113e-6■■■■■ 41.5
DROSHAQ9NRR4 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.13e-6■■■■■ 41.5
DROSHAQ9NRR4 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.683e-6■■■■■ 41.5
DROSHAQ9NRR4 LSM4-205ENST00000597776 446 ntTSL 216.59■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 41.5
DROSHAQ9NRR4 DHRS3-201ENST00000430996 826 ntTSL 328.88■■■□□ 2.218e-7■■■■■ 41.3
DROSHAQ9NRR4 UNKL-210ENST00000508903 3430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.47e-7■■■■■ 41.3
DROSHAQ9NRR4 MGAT1-210ENST00000506033 464 ntTSL 244.03■■■■■ 4.643e-8■■■■■ 41.1
DROSHAQ9NRR4 FAM35A-203ENST00000437629 969 ntTSL 336.93■■■■□ 3.53e-8■■■■■ 41.1
DROSHAQ9NRR4 MGAT1-213ENST00000506889 1104 ntTSL 235.39■■■■□ 3.263e-8■■■■■ 41.1
DROSHAQ9NRR4 MGAT1-224ENST00000514438 607 ntTSL 430.77■■■□□ 2.523e-8■■■■■ 41.1
DROSHAQ9NRR4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.252e-6■■■■■ 41.1
DROSHAQ9NRR4 DALRD3-208ENST00000467457 1591 ntTSL 1 (best)28.92■■■□□ 2.223e-8■■■■■ 41.1
DROSHAQ9NRR4 MGAT1-222ENST00000513431 555 ntTSL 228.04■■■□□ 2.083e-8■■■■■ 41.1
DROSHAQ9NRR4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.672e-6■■■■■ 41.1
DROSHAQ9NRR4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.573e-8■■■■■ 41.1
DROSHAQ9NRR4 MGAT1-216ENST00000508702 313 ntTSL 424.5■■□□□ 1.513e-8■■■■■ 41.1
DROSHAQ9NRR4 MGAT1-217ENST00000510341 553 ntTSL 424.5■■□□□ 1.513e-8■■■■■ 41.1
DROSHAQ9NRR4 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.312e-6■■■■■ 41.1
DROSHAQ9NRR4 MGAT1-218ENST00000510962 445 ntTSL 519.05■□□□□ 0.643e-8■■■■■ 41.1
DROSHAQ9NRR4 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.483e-8■■■■■ 41.1
DROSHAQ9NRR4 MGAT1-219ENST00000512080 532 ntTSL 516.94■□□□□ 0.33e-8■■■■■ 41.1
DROSHAQ9NRR4 MGAT1-221ENST00000513149 356 ntTSL 411.39□□□□□ -0.593e-8■■■■■ 41.1
DROSHAQ9NRR4 MGAT1-225ENST00000514760 613 ntTSL 310.74□□□□□ -0.693e-8■■■■■ 41.1
DROSHAQ9NRR4 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.833e-8■■■■■ 41.1
DROSHAQ9NRR4 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.123e-8■■■■■ 41.1
DROSHAQ9NRR4 MGAT1-215ENST00000508090 475 ntTSL 47.98□□□□□ -1.133e-8■■■■■ 41.1
DROSHAQ9NRR4 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.042e-10■■■■■ 41
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DROSHAQ9NRR4 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.173e-7■■■■■ 41
DROSHAQ9NRR4 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.493e-7■■■■■ 41
DROSHAQ9NRR4 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.682e-9■■■■■ 40.9
DROSHAQ9NRR4 ADD2-205ENST00000413157 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.062e-9■■■■■ 40.9
DROSHAQ9NRR4 ADD2-203ENST00000403045 3745 ntTSL 214.64□□□□□ -0.072e-9■■■■■ 40.9
DROSHAQ9NRR4 ADD2-201ENST00000264436 9267 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.392e-9■■■■■ 40.9
DROSHAQ9NRR4 ADD2-204ENST00000407644 3741 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.392e-9■■■■■ 40.9
DROSHAQ9NRR4 TBKBP1-203ENST00000578982 733 ntTSL 329.58■■■□□ 2.332e-6■■■■■ 40.9
DROSHAQ9NRR4 P3H1-203ENST00000372526 654 ntTSL 328.26■■■□□ 2.123e-6■■■■■ 40.9
DROSHAQ9NRR4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.863e-6■■■■■ 40.9
DROSHAQ9NRR4 P3H1-207ENST00000460031 2726 ntTSL 524.33■■□□□ 1.493e-6■■■■■ 40.9
DROSHAQ9NRR4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.293e-6■■■■■ 40.9
DROSHAQ9NRR4 P3H1-214ENST00000495874 2813 ntTSL 222.87■■□□□ 1.253e-6■■■■■ 40.9
DROSHAQ9NRR4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.13e-6■■■■■ 40.9
DROSHAQ9NRR4 P3H1-213ENST00000492956 3001 ntTSL 1 (best)19.73■□□□□ 0.753e-6■■■■■ 40.9
DROSHAQ9NRR4 PISD-214ENST00000478893 1056 ntTSL 227.56■■■□□ 24e-8■■■■■ 40.9
DROSHAQ9NRR4 PISD-210ENST00000442379 722 ntTSL 222.41■■□□□ 1.184e-8■■■■■ 40.9
DROSHAQ9NRR4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.832e-6■■■■■ 40.8
DROSHAQ9NRR4 ASPSCR1-203ENST00000344865 1041 ntTSL 235.41■■■■□ 3.265e-13■■■■■ 40.8
DROSHAQ9NRR4 ASPSCR1-209ENST00000581484 1001 ntTSL 226.37■■□□□ 1.815e-13■■■■■ 40.8
DROSHAQ9NRR4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.137e-8■■■■■ 40.8
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DROSHAQ9NRR4 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.245e-8■■■■■ 40.7
DROSHAQ9NRR4 GATD1-201ENST00000319863 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.055e-8■■■■■ 40.7
DROSHAQ9NRR4 GATD1-202ENST00000354286 3973 ntTSL 514.54□□□□□ -0.085e-8■■■■■ 40.7
DROSHAQ9NRR4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.842e-7■■■■■ 40.7
DROSHAQ9NRR4 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.592e-7■■■■■ 40.7
DROSHAQ9NRR4 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.492e-7■■■■■ 40.7
DROSHAQ9NRR4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.398e-8■■■■■ 40.6
DROSHAQ9NRR4 REEP6-204ENST00000591735 1026 ntTSL 233.7■■■□□ 2.988e-8■■■■■ 40.6
DROSHAQ9NRR4 PKP3-207ENST00000530695 441 ntTSL 526.51■■□□□ 1.838e-7■■■■■ 40.6
DROSHAQ9NRR4 FADS1-215ENST00000541683 1844 ntTSL 225.83■■□□□ 1.731e-7■■■■■ 40.6
DROSHAQ9NRR4 FADS1-209ENST00000491310 525 ntTSL 521.37■■□□□ 1.011e-7■■■■■ 40.6
DROSHAQ9NRR4 FADS1-203ENST00000424501 926 ntTSL 320.55■□□□□ 0.881e-7■■■■■ 40.6
DROSHAQ9NRR4 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 40.6
DROSHAQ9NRR4 PCMTD1-205ENST00000521046 856 ntTSL 227.33■■□□□ 1.971e-6■■■■■ 40.5
DROSHAQ9NRR4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.811e-6■■■■■ 40.5
DROSHAQ9NRR4 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.081e-6■■■■■ 40.5
DROSHAQ9NRR4 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 40.5
DROSHAQ9NRR4 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 40.5
DROSHAQ9NRR4 PCMTD1-203ENST00000519559 1204 ntTSL 210.99□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 40.5
DROSHAQ9NRR4 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC4.29□□□□□ -1.729e-8■■■■■ 40.4
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