Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TULP4Q9NRJ4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
TULP4Q9NRJ4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
TULP4Q9NRJ4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TULP4Q9NRJ4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TULP4Q9NRJ4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TULP4Q9NRJ4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.77■■■■□ 3
TULP4Q9NRJ4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.77■■■■□ 3
TULP4Q9NRJ4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
TULP4Q9NRJ4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TULP4Q9NRJ4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TULP4Q9NRJ4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TULP4Q9NRJ4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TULP4Q9NRJ4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TULP4Q9NRJ4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TULP4Q9NRJ4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TULP4Q9NRJ4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TULP4Q9NRJ4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TULP4Q9NRJ4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TULP4Q9NRJ4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TULP4Q9NRJ4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TULP4Q9NRJ4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TULP4Q9NRJ4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TULP4Q9NRJ4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TULP4Q9NRJ4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TULP4Q9NRJ4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TULP4Q9NRJ4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TULP4Q9NRJ4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TULP4Q9NRJ4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TULP4Q9NRJ4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TULP4Q9NRJ4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TULP4Q9NRJ4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TULP4Q9NRJ4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TULP4Q9NRJ4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TULP4Q9NRJ4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TULP4Q9NRJ4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TULP4Q9NRJ4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TULP4Q9NRJ4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
TULP4Q9NRJ4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TULP4Q9NRJ4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TULP4Q9NRJ4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TULP4Q9NRJ4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TULP4Q9NRJ4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TULP4Q9NRJ4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TULP4Q9NRJ4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TULP4Q9NRJ4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TULP4Q9NRJ4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TULP4Q9NRJ4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TULP4Q9NRJ4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TULP4Q9NRJ4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TULP4Q9NRJ4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TULP4Q9NRJ4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TULP4Q9NRJ4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TULP4Q9NRJ4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TULP4Q9NRJ4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TULP4Q9NRJ4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TULP4Q9NRJ4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TULP4Q9NRJ4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TULP4Q9NRJ4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TULP4Q9NRJ4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TULP4Q9NRJ4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TULP4Q9NRJ4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.97
TULP4Q9NRJ4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TULP4Q9NRJ4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TULP4Q9NRJ4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TULP4Q9NRJ4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TULP4Q9NRJ4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TULP4Q9NRJ4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TULP4Q9NRJ4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TULP4Q9NRJ4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
TULP4Q9NRJ4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TULP4Q9NRJ4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TULP4Q9NRJ4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TULP4Q9NRJ4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TULP4Q9NRJ4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TULP4Q9NRJ4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TULP4Q9NRJ4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TULP4Q9NRJ4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TULP4Q9NRJ4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TULP4Q9NRJ4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TULP4Q9NRJ4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TULP4Q9NRJ4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TULP4Q9NRJ4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
TULP4Q9NRJ4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TULP4Q9NRJ4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms