Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SH2B1Q9NRF2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SH2B1Q9NRF2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SH2B1Q9NRF2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SH2B1Q9NRF2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SH2B1Q9NRF2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SH2B1Q9NRF2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SH2B1Q9NRF2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SH2B1Q9NRF2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SH2B1Q9NRF2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SH2B1Q9NRF2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SH2B1Q9NRF2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SH2B1Q9NRF2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SH2B1Q9NRF2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SH2B1Q9NRF2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SH2B1Q9NRF2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SH2B1Q9NRF2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SH2B1Q9NRF2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SH2B1Q9NRF2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SH2B1Q9NRF2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SH2B1Q9NRF2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SH2B1Q9NRF2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SH2B1Q9NRF2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SH2B1Q9NRF2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SH2B1Q9NRF2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SH2B1Q9NRF2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SH2B1Q9NRF2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SH2B1Q9NRF2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SH2B1Q9NRF2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SH2B1Q9NRF2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SH2B1Q9NRF2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SH2B1Q9NRF2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms