Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX7

ITM2C, Integral membrane protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2CQ9NQX7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITM2CQ9NQX7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITM2CQ9NQX7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITM2CQ9NQX7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITM2CQ9NQX7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms