Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQL9

DMRT3, Doublesex- and mab-3-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMRT3Q9NQL9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DMRT3Q9NQL9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DMRT3Q9NQL9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DMRT3Q9NQL9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DMRT3Q9NQL9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DMRT3Q9NQL9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DMRT3Q9NQL9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DMRT3Q9NQL9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DMRT3Q9NQL9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DMRT3Q9NQL9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DMRT3Q9NQL9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DMRT3Q9NQL9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DMRT3Q9NQL9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DMRT3Q9NQL9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DMRT3Q9NQL9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DMRT3Q9NQL9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DMRT3Q9NQL9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DMRT3Q9NQL9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DMRT3Q9NQL9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms